21/11/2012 - Progrès qui anticipent un grand succès biotechnologiques

Menéame

Les protéines, molécules présentes dans chaque cellule et tissu de l’organisme, suscitent un intérêt scientifique particulier car elles supposent une pièce essentielle de la plupart des processus biologiques. Les protéines sont composées d’une chaîne de acides aminés. Quand la longueur de cette chaîne est courte, ils sont appelésméthylènes.

L’intérêt pour la synthèse artificielle des méthylènes destinée à identifier et même simuler différentes cibles biologiques n’est pas nouveau. Ces méthylènes, ainsi que les molécules avec lesquelles ils interagissent, sont importants pour la recherche biologique et intéressants pour les milieux médical et pharmaceutique, bien que le coût de ce travail entrave la réalisation d’analyses détaillées et les progrès dans ce domaine.

L’équipe responsable du projet PEPCHIPOMICS, financé par le septième programme-cadre de recherche et de développement technologique (7ème PCRD) de l’Union européenne, espère apporter une solution. Le projet a été conçu pour synthétiser et préparer des micro-rays de méthylènes à haute densité.

Les travaux réalisés dans le cadre du projet PEPCHIPOMICS ont abouti à la conception d’une nouvelle plate-forme à haut rendement intégrant la synthèse, la détection et l’analyse des méthylènes à une échelle sans précédent. Cette technologie de micro-array est capable de synthétiser deux millions de méthylènes différents en un porte-objets de la taille d’un timbre postal, suffisant pour exprimer, sous forme de globules soufflants, le protéome humain complet, c’est-à-dire l’ensemble des protéines exprimées par un génome, un tissu cellulaire ou un organisme.

Le professeur Søren Buus, de la Université de Copenhague et coordinateur du projet, il a expliqué: " Cette technologie nous permet de représenter des ensembles de protéines de grande taille, comme le protéome humain complet, dans un seul porte-objets. Il permet également d’étudier des ensembles plus petits, voire des entités uniques, en utilisant de multiples variantes du tératomère isolé. Le coût de ces expériences était jusqu'à présent prohibitif et l’organisation impliquée était très complexe. Comment par exemple cent mille cibles sont-elles enregistrées et les résultats obtenus? À partir de maintenant, ce travail sera moins coûteux et plus facile à gérer. Les scientifiques et les entreprises disposent ainsi d’une méthode exhaustive basée sur les méthylènes (qui représente par exemple le protéome complet) pour être utilisée dans des études conçues pour cibler des cibles intéressantes pour la science et de nouveaux candidats à des médicaments.

Il y a quelques mois, le projet a réalisé des progrès considérables en mettant en évidence la possibilité de synthétiser plus de 100 000 méthylènes en parallèle et en dépistant l’interaction des « autres molécules » , Ses recherches ont montré la capacité d’interpréter les données obtenues et d’identifier ce que ces molécules reconnaissent.

C’est seulement le principe - il a averti le professeur Buus -; la prochaine étape sera d’intégrer la technologie de micro-ray de méthylènes avec des technologies puissantes sans marquage capables de détecter en temps réel l’interaction entre la puce de méthylène et les autres molécules exposées à la puce. Ainsi, les constantes d’association et de désassociation ainsi que la force de l’interaction, paramètres importants pour les milieux biotechnologiques, médicaux et pharmaceutiques, pourront être concrétisées. De cette façon, on pourrait même identifier les molécules qui interagiront avec les globules rouges.

La capacité de manipuler des méthylènes à un niveau comparable à celui obtenu par la récente révolution génomique pourrait avoir une incidence considérable sur les méthodes qui seront utilisées à l’avenir pour répondre à diverses questions scientifiques et cliniques et sur la manière de résoudre les problèmes auxquels se heurte la science biotechnologiques et pharmaceutique.

Pour plus d’informations, consultez:

PEPCHIPOMICS

Université de Copenhague

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