23/11/2012 - Un cocktail de bactéries pour éliminer les infections

Menéame

Une étude récente a révélé une combinaison de bactéries qui élimine l’infection par Clastridium difficile. Les chercheurs de l’étude ont utilisé des souris pour identifier la combinaison de six bactéries naturellement présentes dans des mammifères qui détruisent une souche très infectieuse de C. difficile, bactérie qui a causé de nombreux décès intrahospitaliers. Trois de ces six bactéries n’ont pas été décrites précédemment. Cette découverte révolutionnaire pourrait avoir de vastes répercussions sur les futures stratégies thérapeutiques et de contrôle.

C. difficile est une bactérie Gram positive qui provoque le météorisme, la diarrhée et la douleur abdominale. En 2011, elle a été impliquée dans plus de 2 000 décès au Royaume-Uni. Cette bactérie fait partie de la microbiote intestinale naturelle et, tandis que d’autres bactéries cohabitent dans l’intestin pour éviter sa prolifération et sa dissémination, elle est totalement inoffensive. Cependant, le traitement par des antibiotiques à large spectre comme clindamycine peut détruire la flore intestinale naturelle, permettant la colonisation par C. diffile.

La souche agressive de C. difficile analysée dans cette étude a été responsable d’épidémies en Europe, en Amérique du Nord et en Australie. Les résultats de l’étude ont été publiés dans la revue PLOS Pathogens.

Les chercheurs ont découvert que cette souche (ribotype 027) présente une période de contagion prolongée et persistante et d’hypervirulence et est très résistante au traitement antibiotique. Il est caractérisé par la libération de spores à haute résistance pendant une longue période de temps très difficile à éradiquer de l’environnement. Cette situation peut se présenter dans les hôpitaux.

Le Dr Trevor Lawley, premier signataire de l’étude, a déclaré que le traitement des souris infectées par la souche persistante de C. difficile était effectué avec une série d’antibiotiques, mais qu’elles recevaient systématiquement un haut degré d’infectiosité ou de virulence. Wellcome Trust Sanger Institute au Royaume-Uni. Nous traitons ensuite les souris avec une transplantation fécale (faits homogénéisés provenant d’une souris saine) et nous parvenons ainsi à éliminer la maladie et l’état d’hypervirulence sans rechutes dans la plupart des cas. La maladie causée par C. difficile est résistante au traitement antibiotique, mais peut être éliminée avec une transplantation fécale, en obtenant la rémission des symptômes et l’élimination du facteur infectieux.

L’équipe a décidé d’aller plus loin et d’isoler la bactérie spécifique responsable de l’élimination de C. difficile et de la restauration de l’équilibre de la flore intestinale. Pour cela, ils ont cultivé de nombreuses bactéries naturellement présentes dans l’intestin de souris, toutes appartenant à l’un des quatre principaux groupes de bactéries présents dans les mammifères. Ils ont analysé de nombreuses combinaisons de ces bactéries jusqu'à isoler un groupe de six qui a éliminé l’infection de la manière la plus efficace.

La combinaison de six espèces bactériennes a éliminé l’infection à C. difficile hypervirulenta chez les souris avec une grande efficacité et matérialisabilité, restaurant la diversité bactérienne naturelle dans l’intestin de la 'C', a déclaré le professeur Harry Flint, auteur senior de l’étude, de l’Université d’Aberdeen, en Écosse (Royaume-Uni).

L’équipe a enlevé les génomes des six bactéries impliquées et comparé leurs arbres philogénétiques pour les identifier plus précisément. Cette analyse a montré que trois des bactéries avaient déjà été identifiées et que les trois autres étaient au contraire de nouvelles espèces. La combinaison contient des bactéries des quatre principaux groupes présents dans les mammifères, avec des différences génétiques entre eux. Les résultats montrent qu’il est possible d’éliminer efficacement C. difficile et le microbiote hypervirulenta en utilisant une combinaison de bactéries naturellement présentes dans l’intestin.

Les résultats de nos recherches offrent la possibilité d’éviter l’utilisation excessive d’antibiotiques et d’exploiter le potentiel des communautés bactériennes naturelles dans le traitement de l’infection à C. difficile et de sa transmission. De plus, cette technique peut être efficace pour traiter d’autres maladies associées à des déséquilibres bactériennes « Ça va être un traitement alternatif » , a expliqué le professeur Gordon Dougan, auteur principal de l’étude, ainsi que le Wellcome Trust Sanger Institute. Ce modèle comprend certaines des caractéristiques du traitement par les selles et constitue une base pour développer une combinaison thérapeutique standardisée.

Pour plus d’informations:

Wellcome Trust Sanger Institute

PLOS Pathogens

Image: Clastridium difficile

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