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Des scientifiques espagnols ont réussi à extraire des informations structurelles d’une triple hélice d’ADN (acide désoxyribonucléique) dans des conditions pratiquement vide (c’est-à-dire dans sa phase gazeuse). L’étude, publiée dans le Journal of the American Chemical Society (JACS), pourrait améliorer les traitements anti-gen fondés sur ce type de structures d’ADN.
Des chercheurs de l’Institut de recherche biomédicale (IRB) et du Centre de supercomputation de Barcelone (BSC, tous deux en Espagne) ont affirmé que personne n’avait réussi à identifier ces structures d’ADN jusqu'à présent.
Ces formes spéciales d’ADN étaient presque impossibles à détecter et étaient inconnues s’ils gardaient la mémoire de leur structure en solution lorsqu'ils se vaporisaient, a expliqué le professeur Modesto Orozco, professeur à l’Université de Barcelone et directeur de l’Unité des sciences de la vie du BSC. Nous avons réussi, grâce à notre travail, à caractériser cette structure et à démontrer qu’elle garde une mémoire surprenante de ce qu’elle était dans son environnement biologique, en solution aqueuse, où il est généralement très difficile de caractériser.
Orozco et son équipe ont combiné des techniques de simulation informatique avec une validation expérimentale à travers la stérilité de masse pour atteindre ces résultats, un travail qui a entraîné plus de dix années d’études de la part de l’équipe d’Orozco. C’était la dernière structure en attente pour compléter le atlas des structures classiques d’ADN en phase gazeuse.
Le travail pourrait accélérer le développement des thérapies antigénaires Sur la base de ces formes d’ADN. Selon l’équipe, l’utilisation thérapeutique de structures d’ADN à trois hélices permettrait de désactiver les gènes qui contribuent au développement d’une maladie.
Le professeur Orozco a expliqué que l’un des principaux obstacles à l’évolution était la difficulté à détecter ces structures de triple hélice. « Démontrer qu’en phase gazeuse la structure est maintenue facilitera la détection de ces formes d ’, a noté le professeur.
Ce travail fournira à la communauté scientifique l’outil nécessaire pour mettre en œuvre de nouvelles techniques de résolution structurelle basées sur l’utilisation de lasers à électrons sans rayons X (X-FEL). Le X-FEL européen est une grande installation scientifique de faisceau de lumière très intense, similaire à un synchrotron, qui est en construction en Allemagne. «i»Si nos calculs sont corrects, X-F EL pourrait être utilisé pour obtenir en phase gazeuse des données structurelles sur la façon dont une molécule est dans son environnement biologique naturel et X-Fel deviendrait un outil très puissant pour résoudre la structure des macromolécules «/i»gt; , a affirmé le scientifique du BSC.
Des experts de l’Université de Liège (Belgique) ont participé à cette étude.
Image: Institut de recherche biologique (IRB)
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Pour plus d’informations:
NIB Barcelona: http://www.irbbarcelona.org/index.php/es
Journal of the American Chemical Society (JACS): http://pubs.acs.org/journal/jacsat
Source
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