
Des scientifiques de 9 centres de recherche espagnols ont séquencé le épigénome de 139 patients leucémie lymphatique chronique.
Les résultats, publiés dans Nature Genetics, révèlent plus d’un million de troubles épigénétiques propres à ce type de cancer qui affecte les globules blancs.
El épigénome représente les changements chimiques qui n’ont pas d’incidence sur la séquence de ADN mais ils peuvent modifier l’expression des gènes en les faisant par exemple taire. Ces variations peuvent apparaître en raison de facteurs environnementaux, et peuvent être héréditaires.
Le travail vient compléter les recherches dans lesquelles le génome complet de quatre patients a été enlevé et l’exome - la partie codifiante de l’ADN - de plus de cent, qui ont révélé plus de mille mutations génétiques impliqués dans le développement de la leucémie lymphatique chronique.
Connaître les interactions moléculaires de l’ADN impliqués dans la maladie donne des indices pour la traiter et la contrôler.
Cette recherche s’inscrit dans un projet international, le Consortium international du génome du cancer (ICGC), auquel participent 11 pays, et qui cherche à déchiffrer le génome de 25 000 patients de différents types de cancer.
Aujourd'hui, les chercheurs ont obtenu un type d’épigénome concret, le méthylme, qui regroupe les méthylations, modifications chimiques consistant en l’ajout d’un groupe méthyle (-CH3) à une molécule. L’étude montre que l’hypométhylation - un degré de méthylation moindre des gènes - est le principal changement épigénétique caractéristique de la leucémie lymphatique chronique.
Les auteurs notent que la méthylation du corps des gènes peut avoir d’importantes implications cliniques dans le développement de ce type de leucémie. La connaissance de l’entraxe moléculaire de l’ADN impliqué dans la maladie pourrait donner des indices pour la traiter et la contrôler.
En outre, le séquençage des épigénomes a permis aux scientifiques de distinguer de nouveaux sous-types de la maladie, en fonction du degré de méthylation différent.
Selon l’étude, les différences de méthylation de l’ADN entre les différents sous-types de ce type de cancer sont associées à leurs cellules d’origine. Cette origine cellulaire différente affecte les caractéristiques biologiques et l’évolution clinique de la maladie.
La leucémie lymphatique chronique est le deuxième type de leucémie le plus courant chez l’adulte et se caractérise par une production excessive de globules blancs anormales ou de cellules leucémiques, qui ne peuvent pas normalement remplir leur fonction de protection de l’organisme contre les agents externes.
Des scientifiques de l’UE ont participé à l’étude. Hospital Clinic de Barcelone, du IDIBAPS et du Centre national d’analyse génétique, également à Barcelone, de la Université Pompeu Fabra, la Université de Barcelone, du Centro Nacional de Investigaciones Oncologicos (CNIO), du Instituto de Investigación Biomedica de Barcelona, du Centro Nacional de Supercomputación et de la Université d’Oviedo.
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Référence bibliographique:
Marta Kulis, Simon Heath, Marina Bibikova, Ana C Queirós, Alba Navarro, Guillem Clot, Alejandra Martínez-Trillos, Giancarlo Castellano, Isabelle Brun-Heath, Magda Pinyol, Sergio Barberán-Soler, Panagiotis Papasaikas, Pedro Jares, Sílvia Beà, Daniel Rico, Simone Ecker, Miriam Rubio, Romina Royo, Vincent Ho, Brandy Klotzle, Lluis Hernández, Laura Conde, Mónica López-Guerra, Dolors Colomer, Neus Villamor, Marta Aymerich, María Rozman, Mónica Bayes, Marta Gut, Josep L Gelpí, Modesto Orozco, Jian-Bing Fan, Víctor Quesada, Xose S Puente, David G Pisano, Alfonso Valencia, Armando López-Guillermo, Ivo Gut, Carlos López-Otín, Elías Campo & José I Martín-Subero. “Epigenomic analysis detects widespread gene-body DNA hypomethylation in chronic lymphocytic leukemia”. Nature. 14 octubre, 2012. doi:10.1038/ng.2443
Image: En couleur plus foncée, leucémie lymphatique chronique (Source: BPC)
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